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    转录组测序(转录组测序怎么选择材料)

    发布时间:2022-10-24 06:19 点击:

      1.植物组织:植物组织一般要求重量大于 4g。首先我们要准备好液氮预冷的无酶管,并做好取样器械的消毒和去RNA酶处理,尽量选取新鲜幼嫩、生长旺盛部位的样本进行迅速采集,然后用RNase-free水对样品表面进行快速的清洗,吸干表面液体之后放入无酶管中液氮速冻(时间不要太短哦),待彻底冷冻后,转移至-80℃冰箱保存。

      2.动物组织:送样的重量一般要求在 2g以上。若在实验室中取样,做好器械的消毒和去RNA酶处理的前期工作后,迅速进行取样。取下的样品用RNase-free水迅速进行冲洗,吸干表面水分,放入预先放置在液氮中预冷的无酶管中,速冻一段时间,转入-80℃冰箱保存;对于野外采样,无法携带液氮等情况时,可以使用RNA保护剂。用RNase-free水对样品表面进行快速清洗,然后迅速切割成规定的大小(约黄豆粒),将样品完全浸没在RNA保护剂中,可以置于4℃中过夜(使保护剂渗透进组织中),转移至-80℃冰箱保存。

      3.细胞样品:转录组测序中,细胞一定要达到足够的数量,以保证抽提的RNA的量。所以对于培养的细胞系,首先要确定细胞数量(建议5×10^6以上)。首先对收集好的细胞用1×PBS清洗几遍,贴壁培养的先用少量胰酶消化一下(切记不要消化过度),离心,弃PBS,加入适量的Trizol裂解液并反复吹打混匀,直至形成清亮透明的液体,转移至无酶管中,放-80℃冰箱保存。细胞量比较少的话,可以联系我们的技术同事,来针对性给出合理化建议以便RNA抽提。

      4.血液样品:血液样本一般要求2ml以上。当然我们要区分全血、血浆还是血清,不同的样本因为自身特性不同需要区别对待。

      全血样品记得一定要用抗凝采血管采集(不推荐肝素抗凝管,可用EDTA、柠檬酸钠抗凝剂的抗凝管),采血后轻轻倒转采血管混合4~5次,使抗凝剂与血液混匀。将采集好的全血快速转移至单独的冻存管或离心管,按照每250ul/管分装,加750ul(即三倍体积)的Trizol LS(家禽、鱼类等红细胞有核物种,按照 1:8 或 1:10 比例添加 Trizol LS/Trizol),混匀。液氮速冻后,放-80℃冰箱保存。每个环节尽可能的快速完成,避免RNA的降解。

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